Európska COVID-19 dátová platforma

Reporty o mutáciách a variantoch SARS-CoV-2 na základe dát zdieľaných na Európskej dátovej platforme COVID-19

Inkubátor HERA: Príprava Európy na varianty COVID-19

Inkubátor HERA, ktorý vo februári 2021 oficiálne predstavila Európska komisia, predstavuje plán pripravenosti EÚ proti variantom COVID-19, ktorý spája výskumníkov, biotechnologické spoločnosti, výrobné firmy, regulačné orgány a verejné orgány s cieľom monitorovať varianty (mutácie) koronavírusu, vymieňať si údaje a spolupracovať na ďalšom vývoji a prispôsobovaní vakcín.

Nové mutácie koronavírusu sú už v Európe bežne prítomné a ECDC (Európske centrum pre prevenciu a kontrolu chorôb) hodnotí riziko ďalšieho šírenia mutácií na vysoké až veľmi vysoké. Niektoré mutácie majú vyššiu schopnosť prenosu a hrozí, že sa môžu stať dominantným kmeňom a dokonca znížiť účinnosť vakcín – ako napríklad „britský“ variant vírusu B.1.1.7, ktorý má v Európe dominantné postavenie (k marcu 2021 vyše 90 %). Budúce mutácie vírusu môžu byť odolné voči súčasným vakcínam a  Európa musí toto riziko predvídať.

Sekvenčná kapacita v EÚ je v priemere nižšia ako 10 %. Zvýšením kapacít sekvenácie sa môžu zistiť ďalšie varianty, ktoré následne budú monitorované.

Pri procese sekvenovania genómu sa mapuje jedinečná genetická stavba rôznych kmeňov vírusuJe kľúčom k identifikovaniu variantov u ľudí i zvierat, ako aj k monitorovaniu ich šírenia v komunitách a populáciách. Umožňuje skúmanie vírusových genómov a skríning mutácií, ktoré môžu mať vplyv na prenosnosť alebo patogenitu. Údaje, ktoré pochádzajú zo sekvenovania celého genómu, zlepšujú chápanie dynamiky prenosu nákazy a presahovania na ľudí aj zvieratá a pomáhajú identifikovať nebezpečné mutácie. Je preto dôležitým nástrojom na prijímanie rozhodnutí a opatrení v oblasti verejného zdravia.

EÚ mobilizuje finančné prostriedky na podporu členských štátov v navýšení kapacít na testovanie a sekvenovanie tým, že podporí vývoj špecializovaných testov na nové varianty koronavírusu (alokovaných najmenej 75 miliónov EUR). Tiež sa poskytnú finančné zdroje na zdieľanie dát o variantoch vírusu a na prispôsobenie vakcín a na navýšenie výrobných kapacít vakcín.

KĽÚČOVÉ OPATRENIA NA ZVÝŠENIE PRIPRAVENOSTI A ZVÝŠENIE KAPACITY NA VÝVOJ VAKCÍN PRISPÔSOBENÝCH VARIANTOM

1. DETEKCIA A ANALÝZA NOVÝCH VARIANTOV VÍRUSU

·       - Zvýšiť kapacitu sekvenovania (na určenie mutácií vírusu).

·       - Umožniť plynulú výmenu informácií o nových variantoch medzi všetkými zainteresovanými stranami, ktoré pracujú na vývoji vakcín.

·       - Identifikovať tzv. únikové varianty (varianty, ktoré dokážu uniknúť imunitnému systému) vzbudzujúce veľké obavy a dosiahnuť dohodu v tejto oblasti.

2. VÝVOJ VAKCÍN PROTI NOVÝM VARIANTOM VÍRUSU, VOČI KTORÝM NEMUSIA BYŤ EXISTUJÚCE VAKCÍNY DOSTATOČNE ÚČINNÉ

·     -   Podpora spoločností, ktoré pracujú na prispôsobení vakcín alebo vývoji nových vakcín.

·      -  Uľahčenie klinického skúšania: zriadenie celoúnijnej siete na klinické skúšanie (VACCELERATE).

·      -  Podpora nových technológií na vývoj prispôsobených alebo nových vakcín.

3. RÝCHLA A MASOVÁ VÝROBA VAKCÍN PRISPÔSOBENÝCH VARIANTOM

·       - Aktualizácia existujúcich dohôd o predbežnom nákupe alebo uzatvorenie nových dohôd o predbežnom nákupe s výrobnými spoločnosťami, ktoré vyvíjajú prispôsobené vakcíny.

·       - Výrobcovia vakcín predložia dôveryhodný plán, ktorým preukážu skutočnú kapacitu na výrobu vakcín v EÚ a budú dodávať požadované množstvá dostatočne rýchlo.

EÚ v tejto súvislosti zriadi Úrad pre pripravenosť a reakcie na núdzové zdravotné situácie (HERA). Úrad HERA bude mať za úlohu predvídať a lepšie zvládať budúce pandémie.

Viac informácií poskytnú nižšie uvedené dokumenty:

Inkubátor HERA – spoločné predvídanie hrozby variantov COVID-19 (Oznámenie Komisie Európskemu parlamentu, Európskej rade a Rade, COM/2021/78 final, slovenský jazyk)  

Factsheet: Príprava Európy na varianty COVID-19: inkubátor HERA (slovenský jazyk)

Questions and Answers: HERA Incubator - Anticipating together the threat of COVID-19 variants (v anglickom jazyku)

Zdroj: ec.europa.eu; zverejnené: 7.4.2021; autor: akr

ERA CORONA PLATFORM

Platforma ERA Corona poskytuje komplexné informácie o možnostiach financovania výskumu COVID-19 na úrovni Európskej únie a na vnútroštátnej úrovni. Ponúka priebežne aktualizované informácie o predĺžení termínov uzávierok výziev Horizont 2020, ponúka informácie o výzvach špecificky zameraných na výskum COVID-19, často kladené otázky a ďalšie užitočné odkazy.

Platforma ERA corona je jednou z 10 priorít, na ktorých sa Európska komisia a národné ministerstvá dohodli v rámci prvého akčného plánu ERAvsCorona.

V spolupráci s korešpondentmi jednotlivých krajín platforma ponúka vyhradenú sekciu pre národné aktivity, možnosti financovania, iniciatívy a projekty v členských štátoch a ďalších európskych krajinách.

Ponúka užitočný prehľad výskumno-inovačných aktivít na Slovensku v boji proti pandémii COVID-19 na jednom mieste. Informácie sú priebežne aktualizované MŠVVaŠ SR, MZ SR a SLORD.

Vstup priamo do sekcie Slovensko - European Research Area (ERA) corona platform - Slovakia

Predĺženie uzávierok výziev

COVID-19 FAQs z Funding & Tenders Opportunities

Podporené projekty H2020 proti COVID-19

Mimoriadna grantová výzva Horizon Europe zameraná na výskum v prípade mimoriadnych udalostí v oblasti verejného zdravia
Mimoriadna výzva v rámci klastra Zdravie v Horizon Europe. Výsledky by mali pomôcť EÚ efektívne a v krátkom čase reagovať na mimoriadne situácie v oblasti verejného zdravia (zverejnené 8.4.2021, deadline: 6.5.2021)

Mimoriadna grantová výzva Horizon Europe v oblasti výskumných infraštruktúr
Ide o osobitnú výzvu s cieľom riešiť výnimočnú núdzu a preto je čas na prípravu projektového návrhu skrátený (zverejnené: 8.4.2021, deadline: 6.5.2021)

Grantová výzva Nadácie ESET – COVID-19 (4.3.2021)

Rezort školstva navýšil financie na vedu a výskum na zníženie dopadov koronakrízy (27.1.2021)

2020

Spoločný prístup EÚ k sledovaniu COVID-19 prostredníctvom monitorovania odpadových vôd
ODPORÚČANIE EÚ o spoločnom prístupe k zavedeniu systematického dohľadu nad SARS-CoV-2 a jeho mutáciami v odpadových vodách v EÚ (17.3.2021)

Prehľad COVID-19 výskumných aktivít a služieb EMBL
Dokument sumarizuje hlavné výskumné aktivity a služby súvisiace s COVID-19, poskytované EMBL (European Molecular Biology Laboratory) k 4.3.2021.

Rok 2022

1. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

2. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

3. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

4. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

5. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

6. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

7. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

8. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

9. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

10. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

Rok 2023

11. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

12. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

13. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

14. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

15. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

16. Monitorovacia správa cirkulujúcich variantov vírusu SARS-CoV-2 v Slovenskej
republike zachytených v systéme NarCoS - Národné Covid-19 Sekvenovanie

Zverejňujeme tiež publikácie slovenských výskumníkov na tému vírusu SARS-CoV-2:

• Systematic Genomic Surveillance of SARS-CoV-2 Virus on Illumina Sequencing Platforms in the Slovak Republic—One Year Experience

Nový portál „Pathogens“, vznikol ako odozva na epidémiu opičích kiahní (MPXV). Obsahuje (zatiaľ) iba MPXV sekvencie. Na portáli sú nahrané aj MPXV sekvencie zo Slovenska.