Vznik národného uzla predstavuje významný krok k systematickému prepojeniu slovenskej vedeckovýskumnej komunity s európskym ekosystémom vied o živej prírode a vytvára pevný základ pre dlhodobú udržateľnosť, medzinárodnú spoluprácu a zvýšenie konkurencieschopnosti slovenského výskumu. „Zapojenie UK do infraštruktúry ELIXIR svedčí o kvalite našich vedcov a vedkýň a o ich prínose do svetového výskumu v oblasti biomedicíny. V najbližšom období sa sústredíme predovšetkým na oblasť genomiky  a bioinformatiky. Našou ambíciou je zapojiť sa do významných európskych projektov financovaných Európskou úniou,“ uviedol prorektor UK pre vedu a doktorandské štúdium Jozef Masarik.

Prorektor zároveň zdôraznil, že formujúca sa infraštruktúra ELIXIR Slovensko bude mať distribuovaný charakter s dvoma hlavnými centrami, a to v Bratislave, kde bude kľúčovú koordinačnú úlohu zohrávať Univerzita Komenského, najmä prostredníctvom Vedeckého parku UK, a v Košiciach na Univerzite Pavla Jozefa Šafárika. „V ďalšej fáze plánujeme národný uzol rozšíriť aj o ďalších partnerov z akademického a výskumného prostredia, aby sme vytvorili skutočne reprezentatívnu a udržateľnú infraštruktúru na národnej úrovni,“ doplnil prorektor Masarik.

„Vstup Slovenska ako členskej krajiny do ELIXIR je významným a vítaným míľnikom, ktorý posilňuje nielen ELIXIR, ale aj slovenskú bioinformatickú komunitu. Tešíme sa na spoluprácu so slovenskými partnermi pri integrácii ich služieb do siete ELIXIR a na zvyšovanie dopadu dátových zdrojov z vied o živej prírode pre výskumníkov v celej Európe“, uviedol vedúci oddelenia vonkajších vzťahov ELIXIR Andrew Smith.

Zriaďovaný národný uzol ELIXIR Slovensko bude poskytovať služby v oblasti biomedicínskych dát a databáz, nástrojov, výpočtových a genomických kapacít, ako aj vzdelávania a informačných podujatí. Medzi pripravované služby patrí napríklad databáza patogénov z národného genomického dozoru, informačný systém pre genomický monitoring NarCoS, ako aj spustenie Federated European  Genome-Phenome Archive, ktorý umožní zapojenie Slovenska do významného medzinárodného projektu Genome of Europe.

Vedecký park UK sa týmto krokom profiluje ako kľúčový národný koordinátor špičkových výskumných infraštruktúr v oblasti vied o živej prírode a bude zastrešovať už druhú národnú platformu európskeho a svetového významu. Tou prvou je European Molecular Biology Laboratory (EMBL), čo potvrdzuje rastúcu medzinárodnú reputáciu a strategickú úlohu Univerzity Komenského v európskom výskumnom priestore.

Výskumná infraštruktúra Vedeckého parku UK – Laboratórium genomiky a bioinformatiky, pod vedením docenta Tomáša Szemesa, ktorá sa stane integrálnou súčasťou národného uzla ELIXIR Slovensko, už od svojho vzniku zabezpečuje podporu odborných pracovníkov na Slovensku aj v rámci Európskeho výskumného priestoru. Centrum poskytuje komplexné hardvérové a softvérové zázemie pre spracovanie, analýzu a dlhodobé uchovávanie genomických a biologických dát a ponúka riešenia pre vysoko náročné analýzy v oblastiach genomiky, transkriptomiky, metagenomiky, epigenomiky či hĺbkovej analýzy patogénov a antimikrobiálnej rezistencie. Súčasťou podpory je aj asistencia pri príprave publikačných výstupov a transfere výsledkov do aplikačnej praxe.

ELIXIR je európska distribuovaná výskumná infraštruktúra, ktorá prepája národné uzly a odborné kapacity v oblasti bioinformatiky, správy a analýzy dát z oblasti vied o živej prírode. Jej cieľom je zabezpečiť, aby boli biologické a biomedicínske dáta udržateľné, interoperabilné a opakovane využiteľné pre výskum, inovácie a spoločenský prospech.

Slovakia becomes ELIXIR member